След демобилизацията на армията, Кеселринг остава на служба в Райхсвера като капитан. В началото на 1933 година е официално уволнен от редовата армия и е назначен в администрацията на Авиационният комисариат, където спомага за създаването на бъдещите нацистки ВВС, а две години по-късно под негово подчинение са всички нетехнически служби на Луфтвафе. След гибелта на генерал В.Вефер, бъдещият пълководец оглавява Министерството на авиацията, което на 1 август 1936 година е преструктурирано в Генерален щаб на Върховното командване на Луфтвафе. Активно участва в подготовката на известния легион ’’Кондор’’, тясно свързан със събитията от Гражданската война в Испания.
На 1 февруари 1939 година Алберт Кеселринг е назначен като главнокомандващ на 1-ви Въздушен флот, чиято роля била поддръжката на група армии ’’Север’’ при офанзивата в Полша.
По време на военната кампания във Франция Кеселринг предвожда 2-ри въздушен флот на Луфтвафе, провеждайки варварски бомбардировки над стратегическите градове на френската отбрана, а през 1940 година, след поражението на 3-ти въздушен флот в ’’Битката за Британия’’ е подведен под отговорност, в резултат на което е прехвърлен на съветско-германската граница. На 1 декември 1941 година е преназначен начело на’’Авиационно командане Юг-Запад’’, действащо в региона на Средиземноморието и Италия. След арестът на Бенито Мусулини, Кеселринг блестящо провежда операцията по окупирането на Италия, за която получава Рицарски кръст. На 24 ноември 1944 година, след зверска автомобилна катастрофа, Алберт Кеселринг е сменен като главнокомандващ нацистките окупационни сили на Апенинския полуостров от генерал Г.фон Фитингоф, но в началото на следващата година отново е назначен на служба като главнокомандващ нацистките сили на Западния фронт.
След края на войната Кеселринг е подведен под отговорност от Английският военен трибунал по обвинение за нехуманно отношение към военнопленници. През 1947 година, след заповед на В. Чърчил, смъртната присъда е променена на 20 години затвор.
През 1954 година, след излежаване на присъдата си Алберт Кеселринг публикува автобиографията си ’’Записките на един войник’’. Животът на фелдмаршал Алберт Кеселринг приключва на 16 юли 1960 година в Германия.
